Ce este un fișier PDB?

Cum se deschide, editează și se convertesc fișierele PDB

Un fișier cu extensia de fișier PDB este cel mai probabil un fișier creat în formatul de bază de date program care este utilizat pentru a deține informații de depanare despre un program sau modul, cum ar fi un fișier DLL sau EXE . Ele sunt uneori numite fișiere de simboluri.

Fișierele PDB cartografiază diferite componente și instrucțiuni dintr-un cod sursă la produsul final compilat, pe care apoi debuggerul îl poate utiliza pentru a găsi fișierul sursă și locația din executabil la care ar trebui să oprească procesul de depanare.

Unele fișiere PDB ar putea fi în format de fișier Protein Data Bank. Aceste fișiere PDB sunt fișiere cu text simplu care stochează coordonatele privind structurile de proteine.

Alte fișiere PDB sunt create probabil în formatul de fișier Palm Database sau PalmDOC și sunt utilizate împreună cu sistemul de operare PalmOS. Unele fișiere în acest format utilizează în schimb extensia de fișier .PRC.

Cum se deschide un fișier PDB

Diferitele programe utilizează propriul fișier PDB pentru a stoca date într-un fel de format de bază de date structurat, astfel încât fiecare aplicație să fie utilizată pentru a deschide propriul tip de fișier PDB. Geneous, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio și Pegasus sunt doar câteva exemple de programe care ar putea folosi un fișier PDB ca fișier de bază de date. Radare și PDBparse ar putea funcționa și pentru deschiderea fișierelor PDB.

Unele fișiere PDB sunt stocate ca text simplu, cum ar fi fișierele de bază de date Debug de program Geneious și sunt complet citite de om dacă sunt deschise într-un editor de text. Puteți deschide acest tip de fișier PDB cu orice program care poate citi documente text, cum ar fi programul Notepad încorporat în Windows. Unii alți telespectatori și editori ai fișierelor PDB includ Notepad ++ și brackets.

Alte fișiere de bază de date PDB nu sunt documente text și sunt utile numai când sunt deschise cu programul pentru care sunt destinate. De exemplu, dacă fișierul dvs. PDB este legat într-un fel de Quicken, încercați să utilizați acel software pentru a vizualiza sau edita fișierul PDB. Visual Studio se așteaptă să vadă un fișier PDB în același folder ca fișierul DLL sau EXE.

Puteți vizualiza și edita fișierele PDB care sunt fișierele Protein Data Bank în Windows, Linux și macOS cu Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB și Chimera USCF pot deschide și un fișier PDB. Deoarece aceste fișiere sunt text simplu, puteți deschide fișierul PDB și într-un editor de text.

Palm Desktop ar trebui să poată deschide fișierele PDB care se află în formatul fișierului Palm Database, dar este posibil să trebuiască să îl redenumiți mai întâi pentru a avea extensia de fișier .PRC pentru acel program să o recunoască. Pentru a deschide un fișier PDD PalmDOC, încercați STDU Viewer.

Cum se convertește un fișier PDB

Fișierele de bază de date ale programului nu pot fi convertite într-un alt format de fișier, cel puțin nu cu un instrument de conversie obișnuit . În schimb, dacă există orice instrument care poate converti acest tip de fișier PDB, ar fi același program care îl poate deschide.

De exemplu, dacă aveți nevoie să convertiți fișierul bazei de date PDB de la Quicken, încercați să utilizați programul respectiv pentru ao face. Acest tip de conversie este, probabil, nu numai de mică folosință, dar și nu este suportat în aceste aplicații de baze de date (probabil că nu este nevoie să convertiți acest tip de fișier PDB în alt format).

Fișierele de fișiere de date Protein pot fi convertite în alte formate cu MeshLab. Pentru a face acest lucru, va trebui să convertiți mai întâi fișierul PDB la WRL cu PyMOL din meniul File> Save Image As> VRML și apoi să importați fișierul WRL în MeshLab și să utilizați meniul File> Export Mesh As pentru a converti în final PDB fișier în STL sau într-un alt format de fișier.

Dacă nu aveți nevoie ca modelul să fie în culoare, puteți exporta fișierul PDB direct în STL cu USCF Chimera (linkul de descărcare este deasupra). În caz contrar, puteți folosi aceeași metodă ca mai sus (cu MeshLab) pentru a converti PDB în WRL cu USCF Chimera și apoi exportați fișierul WRL în STL cu MeshLab.

Pentru a converti PDB în PDF sau EPUB , dacă aveți un fișier PalmDOC, este posibil un număr de moduri, dar cel mai simplu este probabil să utilizați un convertor PDB online ca Zamzar . Puteți să încărcați fișierul dvs. PDB pe site-ul respectiv pentru a avea opțiunea de ao converti la acele formate, precum și la formatele AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT și alte fișiere electronice.

Pentru a converti fișierul PDB în formatul FASTA se poate face cu convertorul FASTA al PDM online al Meiler Lab.

Este, de asemenea, posibil să convertiți PDB la CIF (Formatul de informație cristalografică) online folosind PDBx / mmCIF.

Citirea avansată pe fișierele PDB

Puteți citi mult mai multe despre fișierele bazei de date program de la Microsoft, GitHub și Wintellect.

Mai sunt multe informații despre fișierele Protein Data Bank; consultați Worldwide Data Bank Protein Data și RCSB PDB.

Este fișierul dvs. încă nu se deschide?

Fișierele PDB care nu se deschid cu niciunul dintre instrumentele de mai sus, probabil nu sunt de fapt fișiere PDB. Ce s-ar putea întâmpla este că interpretați greșit extensia fișierului; unele formate de fișiere utilizează un sufix care seamănă foarte mult cu ".PDB" când acestea nu au nicio legătură și nu funcționează la fel.

De exemplu, un fișier PDF este un fișier de document, dar majoritatea programelor de mai sus nu vor face textul și / sau imaginile corect dacă încercați să deschideți unul cu aceste programe software. Același lucru este valabil și pentru alte fișiere cu extensii de fișier similare, cum ar fi PD, PDE, PDC și PDO.

PBD este altul care aparține programului EaseUS Todo Backup și este, prin urmare, util doar atunci când este deschis cu acel software.

Dacă nu aveți un fișier PDB, atunci căutați extensia de fișier pe care o are fișierul dvs., astfel încât să găsiți programul corespunzător care îl deschide sau îl convertește.